RTF I: Genomvielfalt bei chronisch entzündlichen Erkrankungen
Koordinator: Andre Franke (CAU)
RTF I nutzt große Kohorten und genetische Daten, um das Verständnis zu den Ursachen von chronischen Entzündungserkrankungen zu verbessern. Dafür werden umfangreiche Sequenzierdaten mit anderen hochdimensionalen Daten sowie regelmäßig aktualisierten klinischen Informationen kombiniert.
RTF I möchte deutschlandweit den größten genetischen Datensatz für Entzündungserkrankungen generieren.
Worauf baut die Arbeit des Forschungsbereichs auf?
In den letzten Jahren konnten umfangreiche genetische Landkarten von verschiedenen Entzündungserkrankungen erstellt werden, d.h. die häufigsten genetischen Ursachen sind mittlerweile bekannt. Die Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler von RTF I besitzen daher Erfahrung in der Identifikation von genetischen Risikofaktoren und haben die entsprechenden Ressourcen dafür aufgebaut, wie beispielsweise Kartierungstechnologien und -analytik sowie große DNA-Sammlungen.
Was sind die wichtigsten Forschungsziele?
Die Hauptziele des RTF I sind
- Die Generierung eines der größten Entzündungs-Datensätze für die genetische, klinische und epidemiologische Forschung
- Die Identifizierung und Charakterisierung neuer Krankheitsgene und insbesondere die Erkennung und Auflösung der oft "versteckten" monogenen Fälle
- Seltene Varianten zu identifizieren und genetische Widerstandsfähigkeit, sogenannte Resilienz, nachzuweisen
- Klinische Phänotypen zu identifizieren, die mit genetischen Varianten bekannter Funktion (PheWAS) assoziiert sind
- Neue pharmakogenomische Varianten für gezielte Entzündungstherapien nachzuweisen
- Risiko- und Schutzfaktoren bei Verwandten ersten Grades von Erkrankten zu identifizieren
Was zeichnet den Forschungsbereich aus?
Einzigartig ist die Patientenaufklärung und -einwilligung, welche am UKSH in Kiel zum Einsatz kommt, der sogenannte „Broad Consent“. Auf Grundlage dieses Broad Consents konnten die Forschenden eine in den Klinikbetrieb integrierte Biobank aufbauen. Patientinnen und Patienten sowie Ärztinnen und Ärzte unterstützen die Forschung mit Daten und Proben, ohne dass der Routinebetrieb der Krankenversorgung eingeschränkt wird. Mit Hilfe dieser Infrastruktur konnten die Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler bisher Proben und Daten von über 20.000 Patientinnen und Patienten am UKSH für PMI-Forschungszwecke einsammeln. RTF I plant eine genetische Analyse der kompletten Kohorte und möchte deutschlandweit den größten genetischen Datensatz für Entzündungserkrankungen generieren.
Was ist der Beitrag Ihres Forschungsbereichs zu einer Präzisionsmedizin für chronische Entzündungserkrankungen?
RTF I wird einen wichtigen Beitrag für die Präzisionsmedizin leisten, indem "versteckte" monogene und oligogene Krankheitsursachen bei Patienten aus der klinischen Routine identifiziert und aufgelöst werden. Die Reklassifizierung der Krankheitsmanifestation, die Identifizierung effizienter präklinischer/subklinischer Erkrankungen und pharmakogenomischer Marker sind Voraussetzungen für jeden präzisionsmedizinischen Ansatz und wichtige Punkte im Forschungsprogramm der RTF I. Krankheitsübergreifende Analysen werden dazu beitragen sowohl gemeinsame als auch krankheitsspezifische Suszeptibilitätsfaktoren zu identifizieren, übergreifende Behandlungspfade aufzuzeigen und ein besseres Verständnis der Komorbiditäten zu ermöglichen. Insgesamt strebt RTF I eine vollständige Auflösung der genetischen Taxonomie von Entzündungskrankheiten und deren möglicher Transfer in die klinische Versorgung auf individueller Ebene an.
Zusammenarbeit mit anderen Forschungsbereichen im Cluster
- RTF II zwecks Integration von Mikrobiomdaten
- RTF VI für sequenzbasierte Analysen
- RTF X für Familienstudie („Kindred Kohorte“) und klinische Kohorten aus den Entzündungszentren
Mitglieder
Dr. Zouhair Aherrahrou
Assoziiertes Mitglied
Universität zu Lübeck
Institut für Kardiogenetik
Prof. Dr. rer. nat. Norbert Arnold
Vollmitglied
UKSH Campus Kiel
Klinik für Gynäkologie und Geburtshilfe
Onkologisches Labor
Prof. Dr. rer. nat. Petra Bacher
Vollmitglied
UKSH Campus Kiel
Institut für Immunologie
Prof. Dr. John Baines
Vollmitglied
Max-Planck-Institut für Evolutionsbiologie
Institut für Experimentelle Medizin
Evolutionäre Genomik
Prof. Dr. Lars Bertram
Vollmitglied
Universität zu Lübeck
Lübecker Interdisziplinäre Plattform für Genomanalytik (LIGA)
Prof. Dr. Hauke Busch
Vollmitglied
UKSH Campus Lübeck
LIED - Lübecker Institut für Experimentelle Dermatologie
System Biology of Inflammatory Diseases
Prof. Dr. med. Dr. rer. nat. Ingolf Cascorbi
Vollmitglied
UKSH Campus Kiel
Institut für Experimentelle und Klinische Pharmakologie
Prof. Dr. rer. nat. Astrid Dempfle
Vollmitglied
UKSH Campus Kiel
Institut für Medizinische Informatik und Statistik
Prof. Dr. Ingo Eitel
Vollmitglied
UKSH Campus Lübeck
Medizinische Klinik II
Prof. Dr. David Ellinghaus
Vollmitglied
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Klinische Molekularbiologie
Zentrum für Molekulare Biowissenschaften (ZMB)
Dr. Eva Ellinghaus
Vollmitglied
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Klinische Molekularbiologie
Zentrum für Molekulare Biowissenschaften (ZMB)
Prof. Dr. rer. nat. Andre Franke
Vollmitglied
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Klinische Molekularbiologie
Genetics & Bioinformatics
Dr. Jeanette Franzenburg
Assoziiertes Mitglied
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Klinische Molekularbiologie
AG Prof. Franke
Dr. rer. nat. Sandra Freitag-Wolf
Assoziiertes Mitglied
UKSH Campus Kiel
Institut für Medizinische Informatik und Statistik
Prof. Dr. Timo Gemoll
Assoziiertes Mitglied
UKSH Campus Lübeck
Klinik für Allgemeine Chirurgie
M. Sc. Maria Gretsova
Assoziiertes Mitglied
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Klinische Molekularbiologie
AG Prof. Ellinghaus
Dr. rer. hum. biol. Yask Gupta
Assoziiertes Mitglied
UKSH Campus Lübeck
Institut für Entzündungsmedizin
AG Prof. Thaçi
Dr. Seirana Hashemi
Assoziiertes Mitglied
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Klinische Molekularbiologie
Zentrum für Molekulare Biowissenschaften (ZMB)
AG Prof. Ellinghaus
Dr. rer. nat. Matthias Hübenthal
Assoziiertes Mitglied
UKSH Campus Kiel
Klinik für Dermatologie, Venerologie und Allergologie
AG Prof. Weidinger
Prof. Dr. Saleh Ibrahim
Vollmitglied
UKSH Campus Lübeck
LIED - Lübecker Institut für Experimentelle Dermatologie
Genetics of Inflammatory Diseases
Prof. Dr. Josef Ingenerf
Vollmitglied
Universität zu Lübeck
Institut für Medizinische Informatik
Prof. Dr. med. Ralf Junker
Vollmitglied
UKSH Campus Kiel
Institut für Klinische Chemie
Zentrallabor
Prof. Dr. Christine Klein
Vollmitglied
Universität zu Lübeck
Institut für Neurogenetik
Prof. Dr. Inke König
Vollmitglied
Universität zu Lübeck
Institut für Medizinische Biometrie und Statistik
Prof. Dr. rer. nat. Ben Krause-Kyora
Vollmitglied
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Klinische Molekularbiologie
Ancient DNA Research
Prof. Dr. rer. nat. Michael Krawczak
Vollmitglied
UKSH Campus Kiel
Institut für Medizinische Informatik und Statistik
Prof. Dr. med. Wolfgang Lieb
Vollmitglied
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Epidemiologie
Dr. rer. nat. Britt-Sabina Löscher
Assoziiertes Mitglied
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Klinische Molekularbiologie
Zentrum für Molekulare Biowissenschaften (ZMB)
AG Prof. Franke
Prof. Dr. rer. nat. Silke Meiners
Vollmitglied
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Experimentelle Medizin
c/o Forschungszentrum Borstel - Leibniz Lungenzentrum
Immunologie und Zellbiologie
Programmbereich Chronische Lungenerkrankungen
Prof. Almut Nebel
Vollmitglied, PI
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Klinische Molekularbiologie
Longevity Ancient DNA Research
Prof. Dr. Dirk Nowotka
Vollmitglied
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Informatik
Zuverlässige Systeme
Dr. Tobias Reinberger
Assoziiertes Mitglied
Universität zu Lübeck
Institut für Kardiogenetik
AG Prof. Erdmann
Dr. agr. Kristina Schlicht
Assoziiertes Mitglied
UKSH Campus Kiel
Institut für Diabetologie und klinische Stoffwechselforschung
AG Prof. Laudes
Prof. Dr. rer. nat. Ruth Schmitz-Streit
Vollmitglied
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Allgemeine Mikrobiologie
Molekularbiologie der Mikroorganismen
Prof. Dr. med. Stefan Schreiber
Sprecher
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Klinische Molekularbiologie
Prof. Dr. Silke Szymczak
Vollmitglied
Universität zu Lübeck
Institut für Medizinische Biometrie und Statistik
Prof. Dr. Diamant Thaçi
Vollmitglied
UKSH Campus Lübeck
Exzellenzzentrum Entzündungsmedizin
Prof. Dr. Stephan Weidinger
Vollmitglied
UKSH Campus Kiel
Klinik für Dermatologie, Venerologie und Allergologie
Prof. Dr. Inken Wohlers
Assoziiertes Mitglied
Forschungszentrum Borstel - Leibniz Lungenzentrum
Biomolekulare Datenwissenschaft in der Lungenheilkunde
Prof. Dr. Elmar Wolf
Vollmitglied
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Biochemisches Institut