Prof. Dr. Manuel Liebeke
Vollmitglied
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Humanernährung und Lebensmittelkunde
Abteilung Metabolomics
Heinrich Hecht Platz 10
24118 Kiel
Informationen über Prof. Dr. Manuel Liebeke
Manuel Liebeke ist seit April 2023 Professor für Metabolomik am Institut für Humanernährung und Lebensmittelkunde an der Agrar- und Ernährungswissenschaftlichen Fakultät der CAU. Seine Professur ist eine Exzellenz-Professur in den Kieler Lebenswissenschaften als Schnittstelle zwischen lebenswissenschaftlicher und klinischer Forschung.
Sein Forschungsfeld, die räumliche Metabolomik ist hochmodern. Mit ihr ist es möglich, in das Innere der Zellen zu schauen und die komplexen Wechselwirkungen im Stoffwechsel detailgenau zu erforschen. So kann Manuel Liebeke Geheimnisse der zellulären Stoffwechselzustände ergründen, Wirt-Mikroben-Interaktionen auf mikroskopischer Ebene erforschen, metabolische Zellzustände verfolgen und räumliche Abbildungen der metabolischen Aktivität erstellen. Diese Erkenntnisse sind auch für den klinischen Bereich von großer Bedeutung. Sie können zum Beispiel bei der Aufklärung von Krankheitsursachen chronisch-entzündlicher Darmerkrankungen helfen, die auf Störungen des menschlichen Darmmikrobioms beruhen.
„Unsere Forschung fokussiert sich auf die faszinierende Welt chemischer Interaktionen zwischen Organismen. Dabei untersuchen wir insbesondere Lebensgemeinschaften von Tieren und Mikroorganismen. Bei deren Interaktion spielen kleine Moleküle, sogenannte Metabolite, eine zentrale Rolle. Sie entstehen als Zwischenstufen oder Abbauprodukte von Stoffwechselvorgängen der Organismen und bilden das Grundgerüst für die chemische Kommunikation in diesen Partnerschaften. Mit innovativen Techniken wie der massenspektrometrischen Bildgebung und Fluoreszenzmikroskopie versuchen wir die chemische Kommunikation zwischen Bakterienzellen und Wirtszellen zu entschlüsseln und so besser zu verstehen, wie diese Metabolite das Zusammenleben von Tieren und Mikroben beeinflussen und welche Auswirkungen dies auf Ökosysteme und Gesundheit haben könnte.“
Für seine Forschung nutzt Liebeke moderne Massenspektrometrie-Methoden, um zu verstehen, welche Moleküle in Wirt-Mikroben-Systemen beteiligt sind, wie verschiedene Metaboliten ökologische Gemeinschaften formen und wie die Symbiosepartner metabolisch auf Umweltveränderungen reagieren.
Forschungsschwerpunkte:
- Bildgebende Massenspektrometrie zur Visualisierung von Bakterien und deren Metaboliten
- Metabolomik von Umweltproben wie zum Beispiel Seewasser sowie Tier- und Pflanzengewebe.
- metabolische Interaktionen innerhalb von Symbiosen, zum Beispiel zwischen Würmern und den bakteriellen Symbionten.
Vita
Jahr | Tätigkeit | Ort |
---|---|---|
2023 | Professur für Metabolomik am Institut für Humanernährung und Lebensmittelkunde | Christian-Albrechts-Universität zu Kiel |
2012 - 2022 | Gast-Professur | DTU Copenhagen |
2013 - 2018 | Wissenschaftlicher Mitarbeiter | Max Planck Institut für marin Mikrobiologie |
2010 - 2013 | Wissenschaftlicher Mitarbeiter | Imperial College London |
2010 | Promotion in pharmazeutischer Biologie zum Thema „Establishment and application of techniques for microbial metabolomics“ | Universität Greifswald |
2006 | Diplomarbeit am Institut für Pharmazie und Approbation als Pharmazeut | Universität Greifswald |
2001-2005 | Studium der Pharmazie | Universität Greifswald |
Publikationen
*Corresponding author is indicated with underlined
Preprints
- Saharuka, V., Vieira, L. M., Stuart, L., Ekelöf, M., Molenaar, M. R., Bailoni, A., Ovchinnikova, K., Soltwisch, J., Bausbacher, T., Jakob, D., King, M., Müller, M. A., Oetjen, J., Pace, C., Pinto, F. E., Strittmatter, N., Velickovic, D., Spengler, B., Muddiman, D. C., Liebeke, M., Janfelt, C., Goodwin, R., Eberlin, L. S., Anderton, C. R., Hopf, C., Dreisewerd, K., Alexandrov, T.,Biorxiv doi: https://doi.org/10.1101/2024.01.29.577354, “Large-Scale Evaluation of Spatial Metabolomics Protocols and Technologies“
- Kleiner, M., Polerecky, L., Lott, C., Bergin, C., Häusler, S., Liebeke, M., Wentrup, C., Musat, N., Kuypers, M. M. M., Dubilier, N., Biorxiv https://doi.org/10.1101/2023.11.25.568684, „Mechanism of high energy efficiency of carbon fixation by sulfur-oxidizing symbionts revealed by single-cell analyses and metabolic modeling“
- Alexandrov, T., Ovchinnikova, K., Palmer, A., Kovalev, V., Tarasov, A., Stuart, L., Nigmetzianov, R., Fay, D., Liebeke, M, …Key METASPACE Contributors, biorxiv doi: https://doi.org/10.1101/539478, “METASPACE: A community-populated knowledge base of spatial metabolomes in health and disease”
peer-reviewed
2024
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- Zuffa, S., …, Bourceau, P., Liebeke, M., …Dorrestein, P.
Nature Microbiology , in press and bioRxiv 2023.07.20.549584; doi: https://doi.org/10.1101/2023.07.20.549584, „A Taxonomically-informed Mass Spectrometry Search Tool for Microbial Metabolomics Data“
2023
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2022
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- Buck-Wiese, H., Andskog, M., Nguyen, NP, Bligh, M., Asmala, M., Liebeke, M., Hehemann, JH, PNAS 120 (1), e2210561119 (2022), “Fucoid brown algae inject fucoidan carbon into the ocean”
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2021
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Forschung
Metabolomik ist eine Schlüsselmethode in den modernen Lebenswissenschaften, um den Einfluss des Mikrobioms auf unsere Biologie zu ergründen. Sie ermöglicht es, chemische Signale zu entschlüsseln, die das Mikrobiom an die Umgebung sendet. Dabei werden molekulare Stoffwechselverbindungen in biologischen Systemen analytisch erfasst. Gemeinsam mit seinem Team arbeitet Manuel Liebeke am Aufbau einer Metabolomik-Plattform, die in der gesamten Kieler Uni genutzt werden kann.
Die Forschung im Labor wird ständig von Methodenentwicklungen wie der hochauflösenden Massenspektrometrie und Fluoreszenzmikroskopie vorangetrieben, um das räumliche Metabolom von mikrobiellen Systemen aufzudecken.
Forschungsprojekte:
- tbc
Jobs
Wenn Sie daran interessiert sind, unserer Gruppe als Praktikant, BSc, MSc, Doktorand oder PostDoc beizutreten, nehmen Sie bitte per Mail oder Twitter Kontakt auf. Eigene Projektideen sind ebenfalls willkommen und ich bin gerne bereit, Finanzierungsmöglichkeiten zu besprechen, wenn die Themen zu unseren allgemeinen Forschungszielen passen und wir Platz im Labor haben.